Formatos binarios

El complemento al formato textual es el binario, el cual es necesario en ocasiones por eficiencia, o porque no existe manera de representación en formato textual. También, con datos numéricos, podemos perder precisión cuando los convertimos a un formato textual, es entonces cuando es apropiado utilizar el formato binario.

Las funciones para convertir un objeto R en formato binario son save(), save.image() y serialize().

> a <- data.frame(x = rnorm(100), y = runif(100))
> b <- c(3, 4.4, 1/3)
> 
> ##Guardamos a y b en un archivo
> save(a, b, file = "mydata.rda")
> 
> ##Cargamos a y b en el espacio de trabajo
> 
> load("mydata.rda")

Si tenemos muchos objetos que queremos guardar en un archivo, podemos guardar todos los objetos del espacio de trabajo con la función save.image():

> ##Guardamos todos los objetos del espacio de trabajo en un archico
> save.image(file = "mydata.RData")
> 
> ##Cargamos todos los objetos del archivo
> load(file = "mydata.RData")

Obsérvese que hemos utilizado la extensión .rda con la función save() y la extensión .RData cuando hemos utilizado la función save.image(). Esto sólo es una preferencia personal y podemos utilizar cualquier extensión que queramos.Sin embargo, recomiendo el uso de dichas extensiones porque son utilizadas por otros programas.

Por último, la función serialize() se utiliza para convertir objetos R en un formato binario que puede ser transmitido a través de una conexión. Esta podría ser un archivo, pero también podrá ser una conexión de red.

Cuando serializamos un objeto R, el resultado será un vector codificado en formato hexadecimal.

> x <- list(1, 2, 3)
> serialize(x, NULL)

 [1] 58 0a 00 00 00 02 00 03 03 00 00 02 03 00 00 00 00 13 00 00 00 03 00
[24] 00 00 0e 00 00 00 01 3f f0 00 00 00 00 00 00 00 00 00 0e 00 00 00 01
[47] 40 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 0e 00 00 00 01 40 08 00 00 00 00 00
[70] 00

Si lo deseas puedes gravar el resultado en un archivo, sin embargo recomiendo utilizar los métodos anteriores (ej. save()).

El beneficio de serialize() es que es el único modo de representar un objeto R en un formato exportable, sin perder precisión ni metadatos.